Le premier moyen de transport officiel dans le domaine carcéral date probablement de 1806: il s'agissait du cheval personnel du chef de la gendarmerie. Au demeurant, les gendarmes pouvaient, au besoin, réquisitionner les attelages et chariots pour leurs patrouilles et pour le transport de détenus. L'acquisition de véhicules à moteur par les services de police ne s'est faite que bien des décennies plus tard. Jusqu'en 1970, même si un véhicule était à disposition, de nombreux détenus étaient conduits à pied de la prison du district de Berne à l'Hôpital de l'Île.
En 1975, une station de transport a été créée avec une équipe de quatre personnes issues du garage de la Police cantonale. La plupart des transports étaient effectués en train, dans un compartiment sécurisé. Au début, les personnes détenues étaient conduites à pied jusqu'au train. Quelque temps plus tard, la Station de transport s'est installée dans un bureau du bâtiment de la gare, avec trois cellules d'attente et un véhicule électrique.
La police s'est ensuite peu à peu retirée du service de transport pour être remplacée par du personnel civil. Le volume de transports à effectuer augmentant de manière constante, il a fallu plus de ressources. La nouvelle équipe comprenait un responsable, un suppléant et huit chauffeurs.
En 1998, l'ensemble du secteur des prisons a été regroupé dans ce qui s'appelait alors la Direction des prisons du canton de Berne. La Station de transport a déménagé dans le bâtiment de la Prison régionale de Berne.
En raison de l'accroissement continuel du nombre de mandats (transports en provenance et à destination des prisons, des établissements pénitentiaires, des tribunaux et d'autres cantons), la Station de transport, rebaptisée Section de transport, puis Secteur des transports, a emménagé dans ses propres locaux en juin 2006, dans l'enceinte de l'arsenal de Berne.
La Centrale de coordination de la détention a vu le jour à la Prison régionale de Berne en 2018, suite à l'introduction de la séparation des types de détention dans les prisons régionales.
Dans l'optique d'une coordination plus globale des places de détention et d'une exploitation des synergies avec le Secteur des transports, il était nécessaire de faire évoluer les activités de la centrale. C'est pourquoi, le 1er mars 2022, les deux domaines ont fusionné pour donner naissance au Secteur des transports et de la coordination des places de détention.
Des considérations en lien avec la sécurité, mais aussi avec les compétences légales, ont conduit à ce que les tâches de transport soient séparées de celles de coordination pour être à nouveau intégrées à la Police cantonale. Le 1er janvier 2026, le service de coordination a retrouvé son ancien nom et a emménagé à la Gerechtigkeitsgasse 36, à Berne, où il a intégré l'état-major de l'Office de l'exécution judiciaire.
